Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClgnP52194 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClgnP52194 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClgnP52194 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClgnP52194 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClgnP52194 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClgnP52194 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClgnP52194 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClgnP52194 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms