Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TubP50586 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TubP50586 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TubP50586 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TubP50586 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TubP50586 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TubP50586 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TubP50586 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TubP50586 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TubP50586 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TubP50586 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TubP50586 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TubP50586 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TubP50586 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TubP50586 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TubP50586 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TubP50586 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TubP50586 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TubP50586 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TubP50586 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TubP50586 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TubP50586 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TubP50586 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TubP50586 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TubP50586 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TubP50586 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TubP50586 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TubP50586 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TubP50586 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TubP50586 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TubP50586 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TubP50586 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TubP50586 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TubP50586 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TubP50586 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TubP50586 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TubP50586 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TubP50586 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TubP50586 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TubP50586 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TubP50586 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TubP50586 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TubP50586 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TubP50586 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TubP50586 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms