Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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Tmod1P49813 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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Tmod1P49813 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
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Tmod1P49813 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Tmod1P49813 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Tmod1P49813 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Tmod1P49813 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Tmod1P49813 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Tmod1P49813 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Tmod1P49813 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Tmod1P49813 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Tmod1P49813 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Tmod1P49813 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Tmod1P49813 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Tmod1P49813 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Tmod1P49813 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Tmod1P49813 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmod1P49813 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Tmod1P49813 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Tmod1P49813 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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