Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb42P49222 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms