Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx2P48379 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms