Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rplp1P47955 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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