Protein–RNA interactions for Protein: P41317

Mbl2, Mannose-binding protein C, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbl2P41317 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbl2P41317 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbl2P41317 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms