Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tnfsf9P41274 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfsf9P41274 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms