Protein–RNA interactions for Protein: P39688

Fyn, Tyrosine-protein kinase Fyn, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FynP39688 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FynP39688 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FynP39688 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FynP39688 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FynP39688 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FynP39688 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FynP39688 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FynP39688 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FynP39688 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FynP39688 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FynP39688 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FynP39688 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FynP39688 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FynP39688 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FynP39688 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FynP39688 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FynP39688 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FynP39688 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FynP39688 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FynP39688 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FynP39688 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FynP39688 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FynP39688 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FynP39688 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FynP39688 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FynP39688 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FynP39688 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FynP39688 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FynP39688 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FynP39688 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FynP39688 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FynP39688 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FynP39688 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FynP39688 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FynP39688 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FynP39688 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FynP39688 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FynP39688 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FynP39688 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FynP39688 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FynP39688 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FynP39688 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FynP39688 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FynP39688 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FynP39688 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FynP39688 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FynP39688 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FynP39688 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FynP39688 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FynP39688 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FynP39688 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FynP39688 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FynP39688 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FynP39688 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FynP39688 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FynP39688 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FynP39688 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FynP39688 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FynP39688 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FynP39688 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FynP39688 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FynP39688 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FynP39688 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FynP39688 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FynP39688 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FynP39688 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FynP39688 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FynP39688 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FynP39688 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FynP39688 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FynP39688 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FynP39688 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FynP39688 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FynP39688 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FynP39688 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FynP39688 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FynP39688 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FynP39688 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FynP39688 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FynP39688 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FynP39688 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FynP39688 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FynP39688 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms