Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab21P35282 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab21P35282 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab21P35282 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab21P35282 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab21P35282 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms