Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sftpa1P35242 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms