Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc3P33622 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apoc3P33622 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc3P33622 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc3P33622 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc3P33622 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc3P33622 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apoc3P33622 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc3P33622 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc3P33622 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc3P33622 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc3P33622 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc3P33622 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc3P33622 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc3P33622 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc3P33622 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc3P33622 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc3P33622 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc3P33622 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoc3P33622 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc3P33622 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc3P33622 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc3P33622 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc3P33622 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc3P33622 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc3P33622 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoc3P33622 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms