Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Etv4P28322 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Etv4P28322 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Etv4P28322 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms