Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb3P28231 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms