Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd11P23813 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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