Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsta3P23591 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms