Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PparaP23204 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PparaP23204 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PparaP23204 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PparaP23204 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PparaP23204 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PparaP23204 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PparaP23204 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PparaP23204 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PparaP23204 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PparaP23204 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PparaP23204 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PparaP23204 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PparaP23204 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PparaP23204 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PparaP23204 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PparaP23204 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PparaP23204 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PparaP23204 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PparaP23204 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PparaP23204 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PparaP23204 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PparaP23204 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PparaP23204 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PparaP23204 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PparaP23204 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PparaP23204 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PparaP23204 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PparaP23204 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PparaP23204 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PparaP23204 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PparaP23204 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PparaP23204 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PparaP23204 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PparaP23204 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PparaP23204 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PparaP23204 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PparaP23204 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PparaP23204 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PparaP23204 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PparaP23204 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PparaP23204 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PparaP23204 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PparaP23204 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PparaP23204 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PparaP23204 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PparaP23204 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PparaP23204 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PparaP23204 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PparaP23204 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PparaP23204 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PparaP23204 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PparaP23204 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PparaP23204 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PparaP23204 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PparaP23204 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PparaP23204 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PparaP23204 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PparaP23204 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PparaP23204 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PparaP23204 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PparaP23204 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PparaP23204 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PparaP23204 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms