Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms