Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VimP20152 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VimP20152 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VimP20152 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VimP20152 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VimP20152 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VimP20152 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VimP20152 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VimP20152 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VimP20152 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VimP20152 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VimP20152 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VimP20152 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VimP20152 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VimP20152 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VimP20152 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VimP20152 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VimP20152 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VimP20152 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VimP20152 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VimP20152 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VimP20152 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VimP20152 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VimP20152 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VimP20152 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VimP20152 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VimP20152 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VimP20152 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VimP20152 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VimP20152 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VimP20152 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VimP20152 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VimP20152 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VimP20152 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VimP20152 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VimP20152 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VimP20152 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VimP20152 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VimP20152 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VimP20152 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VimP20152 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VimP20152 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VimP20152 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VimP20152 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VimP20152 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VimP20152 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VimP20152 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VimP20152 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VimP20152 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VimP20152 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VimP20152 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VimP20152 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VimP20152 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VimP20152 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VimP20152 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VimP20152 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VimP20152 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VimP20152 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VimP20152 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VimP20152 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VimP20152 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VimP20152 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms