Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdc1P18828 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc1P18828 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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