Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms