Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms