Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd5P13379 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd5P13379 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd5P13379 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd5P13379 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd5P13379 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd5P13379 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd5P13379 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd5P13379 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd5P13379 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd5P13379 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd5P13379 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd5P13379 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd5P13379 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd5P13379 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd5P13379 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd5P13379 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd5P13379 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd5P13379 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd5P13379 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd5P13379 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd5P13379 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd5P13379 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd5P13379 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd5P13379 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd5P13379 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cd5P13379 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd5P13379 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd5P13379 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd5P13379 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd5P13379 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd5P13379 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd5P13379 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd5P13379 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd5P13379 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd5P13379 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms