Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd1d1P11609 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms