Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nid1P10493 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nid1P10493 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms