Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CatspereP0DP43 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms