Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms