Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Egr1P08046 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Egr1P08046 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Egr1P08046 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Egr1P08046 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Egr1P08046 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms