Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spta1P08032 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms