Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ifna6P07350 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms