Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
TtrP07309 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtrP07309 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtrP07309 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtrP07309 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtrP07309 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtrP07309 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtrP07309 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtrP07309 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtrP07309 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtrP07309 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtrP07309 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtrP07309 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtrP07309 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtrP07309 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtrP07309 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtrP07309 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtrP07309 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtrP07309 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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TtrP07309 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtrP07309 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TtrP07309 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtrP07309 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtrP07309 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtrP07309 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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TtrP07309 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtrP07309 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtrP07309 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtrP07309 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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TtrP07309 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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TtrP07309 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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TtrP07309 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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TtrP07309 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtrP07309 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtrP07309 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtrP07309 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtrP07309 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtrP07309 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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TtrP07309 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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TtrP07309 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtrP07309 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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TtrP07309 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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TtrP07309 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtrP07309 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtrP07309 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtrP07309 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtrP07309 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtrP07309 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtrP07309 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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