Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SparcP07214 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SparcP07214 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SparcP07214 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SparcP07214 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SparcP07214 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SparcP07214 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SparcP07214 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SparcP07214 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SparcP07214 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SparcP07214 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SparcP07214 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SparcP07214 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SparcP07214 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SparcP07214 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SparcP07214 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SparcP07214 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SparcP07214 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms