Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgamP05555 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgamP05555 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms