Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt1P04104 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt1P04104 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt1P04104 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt1P04104 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms