Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01680 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01680 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01680 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01680 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01680 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01680 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01680 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01680 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01680 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01680 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01680 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01680 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01680 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01680 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01680 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01680 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01680 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01680 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01680 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01680 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01680 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01680 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01680 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01680 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01680 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01680 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01680 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01680 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01680 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01680 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01680 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01680 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01680 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01680 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01680 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01680 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01680 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01680 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01680 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01680 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01680 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01680 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01680 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01680 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01680 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01680 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01680 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01680 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01680 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01680 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01680 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01680 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01680 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01680 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01680 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01680 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01680 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01680 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01680 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01680 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01680 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01680 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01680 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms