Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01662 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01662 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01662 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01662 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01662 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01662 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01662 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01662 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01662 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01662 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01662 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01662 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01662 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01662 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01662 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01662 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01662 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01662 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01662 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01662 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01662 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01662 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01662 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01662 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01662 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01662 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01662 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01662 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01662 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01662 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01662 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01662 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01662 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01662 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01662 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01662 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01662 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01662 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01662 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01662 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01662 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01662 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01662 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01662 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01662 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms