Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01661 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01661 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01661 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01661 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01661 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01661 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01661 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01661 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01661 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01661 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01661 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01661 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01661 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01661 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01661 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01661 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01661 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01661 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01661 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01661 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01661 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01661 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01661 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01661 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01661 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01661 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01661 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01661 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01661 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01661 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01661 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01661 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01661 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01661 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01661 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01661 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01661 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01661 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01661 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01661 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01661 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01661 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01661 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01661 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01661 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms