Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01649 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01649 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01649 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01649 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01649 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01649 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01649 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01649 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01649 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01649 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01649 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01649 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms