Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
F11rO88792 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F11rO88792 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
F11rO88792 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F11rO88792 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
F11rO88792 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F11rO88792 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F11rO88792 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
F11rO88792 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
F11rO88792 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
F11rO88792 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
F11rO88792 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
F11rO88792 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms