Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops3O88543 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops3O88543 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops3O88543 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops3O88543 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms