Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl22O88430 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms