Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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