Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kdm6aO70546 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms