Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lnx1O70263 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms