Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms