Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole2O54956 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms