Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms