Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NlkO54949 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NlkO54949 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NlkO54949 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NlkO54949 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NlkO54949 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NlkO54949 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NlkO54949 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NlkO54949 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NlkO54949 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NlkO54949 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NlkO54949 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NlkO54949 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NlkO54949 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NlkO54949 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NlkO54949 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NlkO54949 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NlkO54949 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NlkO54949 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NlkO54949 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NlkO54949 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NlkO54949 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NlkO54949 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NlkO54949 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NlkO54949 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NlkO54949 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NlkO54949 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NlkO54949 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NlkO54949 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NlkO54949 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NlkO54949 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NlkO54949 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NlkO54949 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NlkO54949 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NlkO54949 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NlkO54949 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NlkO54949 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NlkO54949 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NlkO54949 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NlkO54949 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NlkO54949 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NlkO54949 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NlkO54949 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NlkO54949 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NlkO54949 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NlkO54949 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NlkO54949 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NlkO54949 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NlkO54949 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NlkO54949 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NlkO54949 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NlkO54949 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms