Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EdaO54693 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EdaO54693 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EdaO54693 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EdaO54693 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EdaO54693 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EdaO54693 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EdaO54693 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EdaO54693 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EdaO54693 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
EdaO54693 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EdaO54693 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EdaO54693 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EdaO54693 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EdaO54693 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EdaO54693 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EdaO54693 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EdaO54693 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EdaO54693 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EdaO54693 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EdaO54693 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EdaO54693 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EdaO54693 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EdaO54693 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EdaO54693 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EdaO54693 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EdaO54693 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EdaO54693 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EdaO54693 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EdaO54693 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EdaO54693 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EdaO54693 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EdaO54693 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EdaO54693 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EdaO54693 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EdaO54693 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EdaO54693 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EdaO54693 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EdaO54693 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms