Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Ccl25O35903 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccl25O35903 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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